其后不久，因为政治原因，海顿侯爵被解职，新任圣战军总司令又换成了费米罗帝国某位元帅，但仍然无法阻止人类联军的溃败。眼见圣战军已经不可倚仗，大秦帝国再次起用在陆基堡军事大学学习的陆正刚，并正式任命时年28岁的陆正刚为大秦帝国三军统帅，晋衔五星上将。
赶到东部战线之后，陆正刚重振大秦军队以及人类联军残部，开始了防守反击。至此，形势才略为好转，但是，东部战区的第一道防线已经被完全攻破，陆正刚不得不组织军队退守第二道防线，并伺机夺回第一道防线——虽然他也知道这有些不可能。
这些年来，安比斯带领他的炼金学院制造出了许许多多威力奇大的魔法武器，并正式装备军队使用。再加上格林带领的诺德骑士、希丁克带领的魔法军团前来助战，仅凭着大秦一国之力，艰难地和魔族对抗着。若不是有着新出来的魔法飞行器、钢铁战舰等空海武器出现，大秦帝国哪里能和上千万的魔族对抗了？
眼见争权夺利已经在圣战军、和平仲裁委员会里出现，感觉到不好苗头的教皇、杜勒姆、龙九三人再次于海拉第安聚首，并对一批争权份子进行了血腥的清洗。其后，经过三人会商，终于任命年龄不足30岁的大秦帝国东部战区总指挥为圣战军总司令，主持人类联军对抗魔族事宜。在陆正刚全部接手圣战军军权后，毫不留情地清洗了一批前来捞取军功的贵族后，圣战军战力大有提升。在507年夏，在第二道防线被攻破情况下，陆正刚带领全军反击，不但将差点打到陆基堡的魔族军队给赶回迷惘森林以东，收复了第二道防线，甚至还差点收复了第一道防线。面对又一场空前的胜利，人类又开始了新一轮的争权……
而在这一轮争权里，大秦帝国也被卷入其中。皇室想修改宪法，重获至高无上的权力，督政院的贵族们更可怕，他们甚至想分裂庞大的大秦帝国，自立为王。眼见强敌虎视，而国内乱成了一团糟，不得矣之下，陆正刚只得请求秩宗陛下出面主持国政，希望在魔族被打退之前，军队可以有个安定的后方。
然而，无处不在的黑暗终于开始全面侵入亚宁大陆各处。在大秦帝国的国内矛盾正成为各国的焦点时，佛朗士帝国与费米罗帝国再次爆发战争，其后不久，特伦帝国也加入到这场大混战里来。本来就何方妖孽《%%》是世仇的达利